Bioconductor 是一個開放原始碼的生物資訊軟體計畫，它提供了一個完整的生物資訊分析工具，廣泛應用於基因體、轉錄組、蛋白質體和代謝體分析等領域。它由 R 語言撰寫而成，並包含了大量經過同儕審查的套件，可供使用者自訂分析流程。
Bioconductor 社群積極參與開發和維護這些套件，確保其品質和準確性。使用者可以透過 Bioconductor 網站或 Bioconductor BiocManager 套件存取這些套件。
Bioconductor 也是一個重要的教育資源，提供線上課程、文件和論壇，幫助使用者學習和應用生物資訊分析技術。
expasy.org 是瑞士生物信息学研究所 (SIB) 维护的一个网站，提供各种生物信息学工具和数据库。
SIB 成立于 1998 年，是瑞士八所大学和两个联邦研究所的联合体。 expasy.org 是 SIB 主要的门户网站，提供以下服务：
expasy.org 是生物信息学研究人员和从业者广泛使用的资源。它提供了一个全面的平台，用于访问和分析生物信息学数据。
基因本体组织（Gene Ontology Consortium）是一个国际合作组织，致力于开发和维护基因本体（GO），这是一种用于描述基因产品功能的受控词汇表。 GO 由三个独立的本体组成：生物过程（BP）、细胞组成（CC）和分子功能（MF）。 GO 用于注释基因组、蛋白质和基因产物的功能，并已被广泛用于基因组学、蛋白质组学和系统生物学的研究中。
Genomebiology.com 是一个同行评审的、开放获取的科学期刊，由 BioMed Central 出版。该期刊发表有关基因组、生物信息学、系统生物学和计算生物学的原创研究文章。
Genomebiology.com 由一群来自不同领域的杰出科学家编辑。该期刊的编辑委员会成员包括：
Genomebiology.com 发表的文章涵盖了基因组学、生物信息学、系统生物学和计算生物学的各个方面。该期刊发表的文章类型包括：
Genomebiology.com 是一个重要的科学期刊，发表有关基因组学、生物信息学、系统生物学和计算生物学的最新研究。该期刊的文章对该领域的科学家和研究人员至关重要。
dna.fr是法国国家人类基因组研究中心（French National Center for Human Genome Research）旗下的网站，于1991年创建。它为研究人员、医疗专业人士和公众提供了有关人类基因组的信息和资源。
该网站包含大量信息，包括：
dna.fr网站是一个宝贵的资源，为人类基因组研究领域的研究人员、医疗专业人士和公众提供了信息和工具。
IDIAP（Idiap 研究院）是一家致力于人工智能和多模态机器学习的研究机构。该机构成立于 1991 年，总部位于瑞士马蒂尼。IDIAP 的使命是进行基础和应用研究，以开发能够解决现实世界问题的人工智能技术。
IDIAP 的研究领域包括：
IDIAP 与学术界、工业界和政府机构密切合作，将其研究成果应用于广泛的应用中，包括：
IDIAP 拥有一支由世界领先的人工智能研究人员组成的团队，并与全球的研究机构和公司建立了广泛的合作关系。该机构还提供研究生教育，并举办会议和研讨会，促进人工智能领域的知识交流。
Ensembl 是一個生物信息學網站，提供多種生物物種的基因組數據。它由歐洲生物信息學研究所 (EMBL-EBI) 維護，是一個開放獲取的資源，可以免費使用。
Ensembl 提供各種數據，包括基因組序列、註釋、變異和表達數據。它還提供各種工具，用於探索和分析這些數據。
Ensembl 是生物醫學研究人員和從業者寶貴的資源。它可用於識別基因突變、研究基因表達，並了解生物學過程。
以下是一些使用 Ensembl 的示例：
Ensembl 是一個不斷發展的資源，定期添加新數據和工具。它是一個寶貴的資源，對生物醫學研究人員和從業者來說必不可少。
bio.site是一个在线生物信息学平台，为生物学家提供了访问和分析生物数据的工具。它包括广泛的数据库、分析工具和可视化功能，使生物学家能够有效地探索和解释生物数据。
bio.site的主要功能包括：
bio.site广泛用于生物医学研究、药物发现和生物技术领域。它为生物学家提供了一个强大的平台，让他们探索和解释复杂的生物数据，从而推动对生命科学的理解和创新。
gene.com是一个基因组学数据库，由美国国家生物技术信息中心（NCBI）维护。它包含了来自各种生物体的基因和蛋白质序列，以及关于基因功能和其他基因组学方面的信息。 gene.com是基因研究的重要资源，它被广泛用于基因克隆、功能分析和疾病研究等领域。
GenomeSize.com是一个基因组大小数据库，它提供了真核生物和原核生物基因组大小的综合信息。该数据库收集了来自不同来源的基因组大小数据，包括发表的文献、基因组项目和个人提交。
GenomeSize.com 提供多种工具和资源来探索和分析基因组大小数据。这些工具包括：
GenomeSize.com 是一个有价值的资源，可用于研究基因组大小在真核生物和原核生物中的变异。该数据库为研究人员提供了一个全面且易于访问的基因组大小数据来源，并为探索基因组大小的进化和功能意义提供了各种工具。
circos.ca 是一家生物信息学公司，为研究人员提供全面的生物信息学服务，包括基因组组装、注释、分析和可视化。
Circos.ca 的旗舰产品是 Circos，这是一个用于可视化基因组数据的开源软件。 Circos 已被用于创建许多高影响力的出版物，包括《自然》、《科学》和《细胞》。
除了 Circos 之外，circos.ca 还提供一系列其他生物信息学服务，包括：
circos.ca 的团队由经验丰富的生物信息学家组成，他们致力于为研究人员提供最高质量的服务。 circos.ca 致力于为研究人员提供负担得起的价格和快速高效的服务。
如果您有兴趣了解更多关于 circos.ca 或其服务的信息，请访问其网站：https://circos.ca。
Cytoscape.org是一个致力于开发和维护Cytoscape软件平台的非营利组织。Cytoscape是一个开源的生物信息学软件平台，用于可视化和分析复杂网络数据。它广泛用于系统生物学、生物信息学和网络科学等领域。
Cytoscape.org提供了一系列资源和服务，包括：
Cytoscape.org还积极参与网络科学领域的教育和外联活动。该组织举办研讨会和培训课程，并与其他组织合作推广Cytoscape的使用。
总体而言，Cytoscape.org是一个宝贵的资源，为Cytoscape用户提供了广泛的支持和服务。
IPK-Gatersleben，全称莱布尼茨植物遗传学与作物植物研究所(Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung)，位于德国加特斯莱本。该研究所成立于1943年，是德国领先的植物科学研究机构之一。
IPK-Gatersleben 的研究重点包括：
该研究所拥有世界领先的植物遗传资源库，包括超过 15 万种植物种质资源。IPK-Gatersleben 与全球 100 多个国家和地区的机构合作，并在国际植物科学研究领域发挥重要作用。
IPK-Gatersleben 的研究成果对农业和食品安全有重要影响。该研究所开发的作物新品种具有高产、抗病虫害、耐逆境等优点，为全球粮食安全和营养改善做出了贡献。
Affymetrix 成立于 1992 年，是一家专注于基因组学分析的生物技术公司。该公司位于加利福尼亚州圣克拉拉，在全球拥有约 1,000 名员工。
Affymetrix 以其基因芯片技术而闻名，该技术用于研究基因表达和基因组变异。该公司还提供一系列其他产品和服务，包括基因分型、基因组测序和生物信息学分析。
Affymetrix 的产品和服务被广泛用于学术研究、制药开发和临床诊断领域。该公司与多家领先的制药和生物技术公司建立了合作伙伴关系，包括罗氏、辉瑞和礼来。
Affymetrix 是一家公开上市公司，其股票在纳斯达克证券交易所交易。该公司 2016 年的收入约为 3.4 亿美元。
GalaxyProject.eu是一个云端平台，用于生物信息学数据分析。该平台由欧洲生物信息学研究所联盟（ELIXIR）和国家生物信息学基础设施（NBIs）开发。
GalaxyProject.eu为研究人员提供了一个友好的界面，可以访问各种生物信息学工具和资源。该平台允许研究人员：
GalaxyProject.eu还提供一系列培训资源，包括教程、研讨会和网络研讨会。该平台可免费用于学术和非营利研究。
要使用GalaxyProject.eu，您需要创建一个帐户。您可以使用电子邮件地址或ELIXIR AAI帐户登录。创建帐户后，您将能够访问平台的工具和资源。
GalaxyProject.eu是一个强大的工具，可用于生物信息学数据分析。该平台易于使用，并提供广泛的工具和资源。如果您正在寻找一个云平台来分析您的生物信息学数据，我强烈推荐您查看GalaxyProject.eu。
OpGen, Inc. 是一家精准医疗公司，致力于在美国及国际范围内开发和商业化分子微生物学解决方案。其产品组合包括 Acuitas AMR Gene Panel，一种体外诊断 (IVD) 测试，用于检测和鉴定从任何标本中分离出的细菌菌落中各种细菌核酸和抗菌素耐药性 (AMR) 的遗传决定因素，以及 Curetis CE-IVD 标记的基于聚合酶链反应的 SARS-CoV-2 检测试剂盒。该公司的产品还包括 ARES 技术平台，包括使用下一代测序技术和人工智能驱动的生物信息学解决方案的 ARES 抗菌素耐药性参考数据库，用于预测抗生素反应；和 Unyvero 平台，这是一个自动化的样本到答案分子诊断平台，它集成了自动化样本制备、分析和鉴定疾病相关病原体和抗生素耐药标记。它还利用分子诊断和信息学来帮助对抗感染性疾病。该公司向临床医生提供有关危及生命感染的信息，以改善患者预后，并减少由多重耐药微生物引起的感染传播。OpGen, Inc. 与纽约州卫生部和 ILÚM Health Solutions, LLC 合作，制定了一项研究计划，以检测、追踪和管理医疗机构中的抗菌素耐药感染。该公司成立于 2001 年，总部位于马里兰州罗克维尔。
LRZ 慕尼黑是巴伐利亚科学院和慕尼黑路德维希-马克西米利安大学联合运营的计算中心。它为巴伐利亚州和德国其他地区的科学计算提供高性能计算 (HPC) 资源和服务。
LRZ 慕尼黑运营着德国最强大的超级计算机之一，称为 SuperMUC-NG。它还提供一系列其他 HPC 资源和服务，包括存储、数据管理和可视化。
LRZ 慕尼黑是欧洲领先的 HPC 中心之一，也是德国研究界的宝贵资源。它支持广泛的科学研究领域，包括气候建模、材料科学和生物信息学。
如果您有兴趣使用 LRZ 慕尼黑的资源，您可以在其网站上找到更多信息：https://www.lrz.de/
生物医学伦理国家委员会
生物医学伦理国家委员会（NBAC）是美国卫生和公共服务部下属的咨询机构，负责制定和审查与生物医学研究和临床实践相关的伦理指南。
宗旨
NBAC 的宗旨是通过考虑伦理、法律和社会影响，促进对生物医学研究和应用的负责任发展。委员会负责：
职能
NBAC 主要执行以下职能：
主要关注领域
NBAC 的主要关注领域包括：
成员
NBAC 由卫生和公共服务部长任命的 15 名成员组成，包括伦理学家、科学家、医生、律师和公众代表。成员任期为三年，可连任一届。
资源
NBAC 提供各种资源，包括：
什么是 myexperiment.org？
myexperiment.org 是一个科学工作流共享平台，允许用户发现、共享和使用其他研究人员创建的科学工作流。它是一个开放访问平台，任何人都可以免费使用。
myexperiment.org 的功能
myexperiment.org 提供以下功能：
myexperiment.org 的优势
myexperiment.org 为研究人员提供了以下优势：
myexperiment.org 的应用
myexperiment.org 已被用于广泛的研究领域，包括生物信息学、化学信息学和地理空间分析。以下是一些示例：
总结
myexperiment.org是一个强大的科学工作流共享平台，为研究人员提供了一系列功能，以提高可重复性、促进协作、节省时间和支持开放科学。它已被广泛用于各种研究领域，并已成为科学工作流共享和发现的关键资源。
Biology Online 是一个提供生物学信息和研究工具的在线平台。它由 Giovanni Stracquadanio 于 2000 年创立，旨在为生物学教育者、研究人员和学生提供一个方便、全面且免费的资源。
Biology Online 提供广泛的生物学主题内容，包括：
除了内容之外，Biology Online 还提供各种研究工具，例如：
Biology Online 已成为生物学社区的重要资源，每月有超过 100 万访客。该网站不断更新，以反映生物学领域的最新进展。
除了网站之外，Biology Online 还提供各种教育资源，例如：
Biology Online 致力于促进生物学教育和研究。该网站和资源均为完全免费使用，旨在惠及全球的生物学社区。
Rabix.io 是一个云平台，旨在使生物信息学家能够创建和共享可重现的生物信息学分析管道。它提供了一个友好的用户界面，使研究人员能够在图形化界面中拖放操作，以创建复杂的工作流。 Rabix.io 还提供了一系列工具和服务，以帮助研究人员管理和共享他们的管道，包括版本控制、容器化和云资源管理。
Rabix.io 是一个强大而灵活的平台，可用于创建和共享广泛的生物信息学分析管道。它由广泛的研究人员和开发人员社区支持，并不断更新和改进。 Rabix.io 是希望提高其分析管道可重现性、可移植性和共享性的生物信息学家的宝贵资源。
流感档案库 (influenzaarchive.org)是一个公开的数据库，其中包含 100 多年来收集的超过 100,000 种流感病毒的基因序列数据。该数据库由美国国立卫生研究院 (NIH) 国家过敏和传染病研究所 (NIAID) 资助。
流感档案库收集到的数据对于研究流感病毒、开发诊断和治疗方法以及跟踪病毒随时间推移的演变至关重要。该数据库允许研究人员在研究流感时共享和分析数据。
流感档案库还为流感研究界提供资源，包括：
流感档案库是一个宝贵的资源，为研究人员提供了研究和了解流感病毒所需的工具和信息。
ZincBind.net是一个免费的锌指设计在线工具。它允许用户构建和优化锌指序列，用于定制核酸靶向应用，例如基因组编辑、转录调节和基于锌指的成像系统。
ZincBind.net的特点包括：
ZincBind.net是研究人员、生物技术公司和制药公司等广泛用户群体在锌指设计和开发中的宝贵工具。它为优化锌指序列、预测其特异性和优化其功能提供了综合且易于使用的平台。
UCSC 基因组浏览器 (UCSC-CGL) 是一个用于可视化和分析基因组数据的 Web 应用程序。它由加州大学圣克鲁斯分校的生物信息学团队开发并维护。
UCSC-CGL 允许用户浏览不同物种的多个参考基因组，包括人类、小鼠、果蝇和大肠杆菌。它还提供了多种工具来分析基因组数据，包括：
UCSC-CGL 已被广泛用于研究人员和临床医生，以探索基因组数据，了解基因功能，并诊断疾病。它是生物信息学研究的宝贵工具，也是基因组信息的有价值来源。
Epi2me.io 是一个交互式在线平台，它允许研究人员和临床医生探索表观遗传数据，包括来自 ENCODE、Roadmap Epigenomics 和 Blueprint 等主要项目的公开数据集。该平台旨在使探索表观遗传数据变得容易，并促进研究人员之间的协作。 Epi2me.io 的一些主要功能包括：
Epi2me.io 是一个强大的工具，可用于探索和可视化表观遗传数据。该平台旨在使表观遗传数据的访问变得更容易，并促进研究人员之间的协作。
Sysbio.se 是一个由瑞典科学委员会（Vetenskapsrådet）资助的生物信息学平台，为研究人员提供数据分析和存储服务。该平台主要针对生命科学领域的学者，旨在整合来自不同来源的数据，以帮助他们更好地了解生物系统。
Sysbio.se 提供以下服务：
Sysbio.se 是一个开放平台，任何研究人员都可以注册和使用。该平台对所有用户免费，并且不收取任何费用。要了解更多信息或注册成为用户，请访问 Sysbio.se 网站：https://www.sysbio.se/
蛋白质数据库日本（PDBj）是一个生物数据库，为科学家提供3D蛋白质结构信息。PDBj由国立遗传学研究所（NIG）运营，是蛋白质数据库（PDB）的三个官方数据存款库之一。
PDBj收集、整理和分发来自X射线晶体学或核磁共振（NMR）光谱学的蛋白质结构数据。它为研究人员提供了各种工具和资源，用于可视化、分析和理解蛋白质结构。
PDBj数据库包含超过15万个蛋白质结构，这些结构来自各种来源，包括人类、动物、植物、细菌和病毒。这些结构数据对于理解蛋白质功能、疾病机制和药物设计至关重要。
PDBj网站提供了一个搜索界面，允许研究人员根据蛋白质名称、序列或其他参数搜索蛋白质结构。该网站还提供各种可视化工具，用于查看和交互蛋白质结构。
此外，PDBj还提供教育和外展资源，帮助学生和非科学家了解蛋白质结构和蛋白质数据库。
总之，PDBj是一个重要的生物数据库，为科学家和研究人员提供蛋白质结构信息和工具，这些信息和工具对于理解生物过程和疾病至关重要。
OpenSNP.org 是一个对人类基因组突变进行记录和存档的数据库，也是世界领先的 SNP（单核苷酸多态性）数据库，包含大量来自不同来源的 SNP 信息。
OpenSNP.org 的主要功能包括：
OpenSNP.org 的数据来自广泛的来源，包括：
OpenSNP.org 的数据经过严格的质量控制和注释，以确保其准确性和可信度。 OpenSNP.org 还定期更新，以包含新的 SNP 数据和注释。
OpenSNP.org 是一个宝贵的资源，可用于 SNP 研究、遗传学和精准医学。它为研究人员和从业者提供了一个综合的平台，用于访问、分析和解释 SNP 数据。
JBrowse 是一个用 JavaScript编写的基因组浏览器，它可以让用户交互式地可视化基因组数据。它具有以下特点：
跨浏览器兼容性:JBrowse可以在所有主流浏览器中使用，包括 Chrome、Firefox、Safari 和 Edge。
高度可配置:JBrowse可以高度定制，以满足特定的需求。用户可以通过插件系统添加功能，并使用主题系统更改外观。
强大的注释支持:JBrowse支持各种注释格式，包括BED、GFF、VCF 和 BAM。
交互式可视化:JBrowse允许用户放大、缩小并平移基因组数据。他们还可以单击特征以获取更多信息。
协作功能:JBrowse提供协作功能，例如共享会话和注释。
JBrowse广泛用于基因组研究，因为它可以轻松地可视化和分析复杂的基因组数据。它特别适用于大型基因组，因为它可以高效地处理和渲染大量数据。
以下是一些JBrowse的示例用例：
基因组浏览:JBrowse可以用来浏览基因组数据，并识别基因、外显子和内含子等特征。
变异分析:JBrowse可以用来分析变异数据，并识别突变、插入和缺失。
比较基因组学:JBrowse可以用来比较不同基因组的序列和注释。
基因组注释:JBrowse可以用来注释基因组数据，并添加注释，如基因预测、转录本和调控元件。
如果您有兴趣了解更多有关JBrowse的信息，请访问其官方网站：https://jbrowse.org/。
comp-sys-bio.org 是一个由计算科学家和系统生物学家组成的社区，共同开发、使用和推广计算和系统方法来理解生物系统。该社区的目标是促进不同学科之间以及计算和实验方法之间的合作，以推进对生物学的理解。
该社区通过举办会议、研讨会和网络研讨会来促进互动。它还维护一个有关计算系统生物学资源、工具和软件的目录。
comp-sys-bio.org社区是计算和系统生物学领域的一个宝贵资源。它为研究人员提供了连接、协作和了解最新进展的机会。
BioJava 是一个开放源码的 Java 库，用于生物信息学计算。它为常见生物信息学任务提供了广泛的算法和数据结构，包括序列比对、分析、可视化和机器学习。
BioJava 的主要优点包括：
BioJava 用于各种生物信息学应用程序，包括：
BioJava 由剑桥大学的生物信息学服务团队开发和维护。它已广泛用于学术界和工业界，并被认为是生物信息学计算领域的主要工具。
elix-lsf.fr是法国国家生命科学基础设施（ELIXIR法国）运营的高性能计算平台。它为生命科学、生物信息学和bio-IT项目提供计算和存储资源。
关键特性:
优势:
目标受众:
elix-lsf.fr 适用于生命科学领域的研究人员、科学家和生物信息学家，他们需要高性能计算资源来处理以下类型的数据和分析：
访问:
访问 elix-lsf.fr 需要提交项目提案并获得 ELIXIR 法国批准。有关更多信息，请访问 elix-lsf.fr 网站。
创新基因组学组织（Innovative Genomics Institute，简称IGI）成立于2014年，是由加州大学伯克利分校、加州大学旧金山分校和斯坦福大学医学院合作创立的，旨在促进基因组学研究和其在医疗保健领域的应用。
IGI的使命是：通过将工程、计算机科学、生物医学和临床实践方面的专家聚集在一起，加速人类基因组学的发现和应用，以改善人类健康。
IGI的研究重点包括：
IGI还运营着一个创新孵化器，为致力于将基因组学应用于医疗保健的初创公司提供支持。
IGI的愿景是创建一个由基因组学驱动的医疗保健未来，让每个人都能获得个性化的、预防性的护理。
生物信息学百科
Biol.me 是一个生物信息学百科全书，提供有关生物学和医学术语、概念和工具的全面信息。它是研究人员、学生和生物信息学领域专业人士的重要资源。
内容覆盖
Biol.me 涵盖广泛的生物信息学主题，包括：
特点
Biol.me 具有以下特点：
使用案例
Biol.me 可用于各种用途，包括：
其他资源
除了百科全书外，Biol.me 还提供以下附加资源：
总的来说，Biol.me 是一个宝贵的资源，为生物信息学领域提供了全面且权威的信息。它对于研究人员、学生和专业人士了解这一重要学科至关重要。
InterMine 是一个生物信息学平台，它使您可以探索生物数据（例如基因，蛋白质和通路）及其来自不同物种的关系。它是一个开放源码平台，由剑桥大学生物信息学研究所开发。
InterMine 的主要特点包括：
InterMine 已用于广泛的生物学研究，包括：
InterMine 是一项强大的工具，可用于探索生物数据并深入了解生物系统。它对于生物信息学家，生物学家和其他希望了解生物学复杂性的人来说是一个宝贵的资源。
要了解更多信息，请访问 InterMine 网站：https://www.intermine.org
QIIME 2 是一套用于微生物序列数据分析的软件包。它旨在易于使用、可定制且可重复。 QIIME 2 具有广泛的插件生态系统，可让您轻松添加新功能。
QIIME 2 的一些主要功能包括：
QIIME 2 是一个强大的工具，可用于各种微生物研究。它易于使用、可定制且可重复，使其成为微生物序列数据分析的理想选择。
GalaxyProject.org 是一个开源的、基于网络的生物信息学平台，它使科学家能够在没有任何编程经验的情况下执行复杂的生物信息学分析。它提供了对广泛的生物信息学工具和数据集的访问权限，以及一个用户友好的界面，使得初学者和有经验的研究人员都可以轻松地创建、运行和共享分析管道。GalaxyProject.org 还提供了一个协作环境，允许研究人员共享数据和管道，并共同努力进行研究项目。
Folds.net 是一个分布式计算项目，旨在预测蛋白质的结构。它使用志愿者的计算机来进行计算，并公开其结果以供研究人员使用。
该项目成立于 2000 年，迄今为止已经预测了超过 100 万个蛋白质的结构。它已用于帮助理解多种疾病，包括阿尔茨海默病、帕金森病和癌症。
Folds.net 是一个志愿者驱动的项目，任何人都可以参与其中。要参与，您需要下载并安装 Folds.net 客户端软件。该软件将在您计算机空闲时运行，并对蛋白质结构进行计算。
如果您有兴趣帮助 Folds.net，您可以从其网站下载客户端软件。
PyMOLWiki 是一个基于 MediaWiki 的维基网站，致力于为分子建模和可视化软件 PyMOL 提供详细的技术文档和教程。它由一群热心的 PyMOL 用户和开发人员维护，提供有关软件各个方面的全面信息。
PyMOLWiki 的主要目的是帮助用户深入了解 PyMOL 的功能和用法。它涵盖了从基本概念到高级技术的所有内容，包括：
除了技术文档外，PyMOLWiki 还提供了以下资源：
总的来说，PyMOLWiki 是一个宝贵的资源，适用于初学者和经验丰富的 PyMOL 用户。它提供了全面的信息、教程和支持，帮助用户充分利用这款强大的分子建模和可视化软件。
www.biocyc.org 是一个免费的、开放获取的生物通路数据库。它是一个协作项目，目前包含 2240 多种生物体的 352 条通路，涵盖从细菌到真核生物的广泛范围。 BioCyc 提供多种工具来探索和分析在线通路图，包括基于文本的搜索、BLAST、SparCLE 序列比对工具和下载选项。
Seqanswers.com 是一个生物信息学网站，提供各种资源，包括教程、文章、代码和工具，以帮助研究人员在他们的研究中使用生物信息学。该网站还提供了一个活跃的论坛，用户可以在其中讨论生物信息学主题并寻求帮助。
Seqanswers.com 由 Emmanuel Nicolas 于 2005 年创立，此后已成为生物信息学研究人员的宝贵资源。该网站由志愿者团队维护，他们致力于提供准确、最新的信息。
Seqanswers.com 内容广泛，包括：
Seqanswers.com 论坛是一个活跃的社区，用户可以在其中讨论感兴趣的主题，并相互帮助解决问题。该论坛还由 Seqanswers.com 志愿者团队管理，他们致力于提供一个友好、尊重的环境。
Seqanswers.com 是一个宝贵的资源，为生物信息学研究人员提供广泛的信息和支持。这个网站是一个学习和了解生物信息学的好地方，也是一个与其他研究人员联系和协作的好地方。
Bio.tools 是一个免费的在线平台，它为生物信息学家提供了一系列工具，以探索，设计和分析生物数据。
Bio.tools 汇集了超过 5000 种工具, 从最受欢迎的基因组浏览器到小工具，再到资源丰富的数据集。这些工具根据不同的类别进行组织，例如：
Bio.tools 最显著的优势之一是其直观的界面，它使非技术人员也可以轻松找到所需的工具。用户可以通过名称，描述，类别，平台和输入/输出数据类型来过滤工具。
除了工具搜索功能之外，Bio.tools 还提供了其他有用的功能，例如：
Bio.tools 一直在持续更新和改进，以满足不断发展的生物信息学领域的需求。它是一个宝贵的资源，可以为生物学家节省大量时间和精力，并使他们能够更有效地利用生物数据。
nicabm.com是一个学术网站，旨在为生物医学研究人员提供最新的研究进展、方法和工具。该网站由国家生物医学成像生物信息学中心（NBIB）运营，NBIB是美国国立卫生研究院（NIH）国家癌症研究所（NCI）的一个分支机构。
nicabm.com提供以下资源：
nicabm.com是一个宝贵的资源，为生物医学研究人员提供了获取最新信息和工具所需的平台。
Genome.org是一个基因组学、蛋白质组学和其他生物信息学的教育、信息和新闻门户网站。它由美国国家人类基因组研究所（NHGRI）于1996年创立，旨在向神道、范围广泛的受众传播人类基因组计划和相关研究的最新进展。
Genome.org的使命是为学生、研究人员、临床医生、决策者和公众提供易于理解且可靠的信息和资源，以获得对基因组学，并促进遗传学研究和转化为医学的理解。
Genome.org提供以下方面的全面信息：
Genome.org是获取基因组学信息和资源的一个宝贵来源，它为所有人提供了了解这一快速发展的领域所需的支持和工具。
PredictProtein是一个蛋白质序列分析和预测的综合平台，为研究人员提供了各种工具和资源，以深入了解蛋白质的结构、功能和相互作用。
主要功能:
资源:
应用:
PredictProtein广泛应用于蛋白质研究的各个领域，包括：
PredictProtein由欧洲分子生物学实验室（EMBL）开发和维护，是蛋白质研究界广泛使用的宝贵资源。
OpenBabel 是一个化学工具包，它提供了一种操作各种化学数据文件格式、分子和反应的统一方法。它是一个开源项目，由 C++ 编写，并附有 Python、Java、C#、Perl、Ruby 等语言的接口。
OpenBabel 的主要功能包括：
OpenBabel 广泛应用于化学和生物信息学领域，用于数据转换、分子建模、药物设计和计算化学等任务。
omictools.com是一个生物信息学工具的综合平台，提供超过1000个工具和数据库，用于分析和可视化基因组、转录组、蛋白质组和代谢组数据。该平台由慕尼黑工业大学的 Steffen Heyne 等人创建，旨在为研究人员提供一个一站式解决方案，用于探索和分析生物数据。
omictools.com 的主要功能包括：
omictools.com 的工具和数据库涵盖了广泛的生物信息学应用，包括：
omictools.com 是一个宝贵的资源，适用于生物信息学家、分子生物学家和其他需要分析和解释生物数据的研究人员。该平台提供了一个全面的工具集，可帮助用户有效地进行生物信息学分析并获得有意义的见解。
Genometools.org 是一个免费的在线生物信息学平台，为研究人员提供了一系列工具和资源，用于分析和可视化基因组数据。
该平台包括：
Genometools.org 旨在帮助研究人员:
该平台适用于各种研究领域，包括:
使用 Genometools.org 的优势包括:
欲了解更多信息，请访问 Genometools.org 网站：https://genometools.org/
Gencodegenes.org是一个多物种基因组注释数据库，其中包含来自人类、小鼠和斑马鱼的基因组注释。该数据库由欧洲生物信息研究所（EMBL-EBI）维护，并由国际基因组学联盟（IGAC）资助。
Gencodegenes.org提供的注释基于RNA-seq和全长cDNA序列数据，并经过手动验证。该数据库包含以下信息：
Gencodegenes.org是一个宝贵的资源，可用于研究基因组学、转录组学和基因调控。该数据库可通过网站和应用程序编程接口（API）访问。
Biostars 是一个生物信息学和计算生物学的研究人员、科学家和开发人员的在线社区。它于 2009 年推出，是一个由社区驱动的平台，为人们提供了一个讨论、提问、回答有关生物信息学主题的问题并分享知识和经验的场所。
Biostars 的主要功能包括:
**Biostars 社区非常活跃，有超过 25 万名注册用户。**社区成员包括生物信息学家、计算生物学家、计算机科学家、统计学家和生物学家。 Biostars 是一个开放和包容的社区，欢迎所有对生物信息学感兴趣的人。
Biostars 是一个宝贵的资源，可以与生物信息学和其他相关领域的专业人士建立联系，学习新的技术，并了解最新的研究和进展。
Gersteinlab.org 是杜克大学计算生物学家马西莫·格斯坦 (Massimo Gerstein) 领导的研究实验室的官方网站。该网站提供有关实验室研究、出版物、软件、教育计划和团队成员的信息。
该实验室的研究重点是利用计算和实验方法研究基因组学、蛋白质组学和网络生物学。实验室开发了用于分析基因组和蛋白质组数据的各种软件工具，包括 Galaxy、Ensembl 和 UCSC Genome Browser。
该实验室还参与了多项教育计划，包括杜克大学计算生物学研究生课程和基因组学虚拟研究环境 (VRE)。
该网站包括以下部分：
该网站对于了解该实验室的研究活动、软件工具和教育计划很有用。
BioGRID 是一个生物交互数据库，它收集了从文献中整理的经过实验验证的蛋白质和遗传相互作用。它由加州大学圣地亚哥分校的生物学系维护。
BioGRID 的目的是为研究人员提供一个集中的资源，以便他们可以访问经过验证的相互作用数据。这些数据可用于各种研究，包括：
BioGRID 包含来自广泛来源的数据，包括：
数据经过严格的审查过程，以确保其准确性和可靠性。
BioGRID 提供了多种查询和可视化工具，使研究人员可以轻松浏览和分析数据。这些工具包括：
BioGRID 是一个重要的资源，已广泛用于蛋白质相互作用的研究。它为研究人员提供了一个宝贵的工具，可用于了解蛋白质功能和构建更准确的生物学模型。
关于CodeOcean.com
CodeOcean是一个云端计算平台，它允许研究人员和开发人员编写、运行和分享代码。它提供了一个交互式环境，人们可以在其中协作、重现分析并轻松理解代码。
特点
优势
用途
定价
CodeOcean提供多种定价计划，包括免费版、专业版和企业版。
BioPerl是一个开放源码软件项目，它是一组基于Perl计算机编程语言的生物信息学程序。该项目的目标是提供一个Perl程序员可以用来进行生物信息学分析的库和工具。
BioPerl包含许多模块，用于读取和写入各种生物信息学数据格式，例如FASTA、GenBank和PDB。它还包含许多用于序列分析、比较基因组学和分子进化研究的工具。
BioPerl被广泛用于生物信息学研究中，并已应用于发表在同行评审期刊上的众多研究中。该项目由一个活跃的开发人员社区维护，不断添加新功能和改进。
BioPerl文档对该项目以及如何使用它进行了全面概述。该项目还提供了一个论坛，用户可以提出问题并获得其他用户的支持。
BioPerl是一个强大的工具，可用于生物信息学研究。它易于使用，并得到一个活跃的开发人员社区的支持。
Nextflow 是一个基于 Groovy DSL 的开源工作流管理系统，旨在简化复杂生物信息学和数据密集型管道开发。它提供直观且简洁的语法，允许用户轻松定义和执行计算、数据操作和工作流协调任务。
特性:
应用:
优势:
资源:
wf4ever-project.org 是一个关于 wf4ever 项目的网站。wf4ever 项目是一个开源的科学工作流程管理系统，用于帮助科学家管理和共享他们的研究数据和工作流程。该网站提供有关 wf4ever 项目的详细信息，包括其功能、如何使用它以及如何为该项目做出贡献。
Arabidopsis.org 是一个关于拟南芥的研究和信息的中心。它提供了各种工具和资源，包括：
BioPython 是一个使用 Python 开发的跨平台的生物信息学工具箱。它提供用于处理各种生物数据格式和执行生物学分析的模块。
主要功能
优点
应用
WhoNamedIt.com 是一个免费的生物医学术语词典，旨在为用户提供信息充足、查找方便的生物医学术语词典。它由英国学者 Olry Terquem 于 1995 年创建，他希望创建一个“术语用户手册”，以了解生物医学术语的起源和演变。如今，WhoNamedIt.com 已成为生物医学术语的主要来源之一，拥有超过 170 万个条目和 150 万个交叉引用。该网站包含有关解剖学、生物化学、细胞生物学、胚胎学、遗传学、微生物学、神经科学、病理学、药理学和生理学等广泛生物医学领域的术语信息。WhoNamedIt.com 还提供传记信息超过 31,000 名科学家、医生和与生物医学术语发展相关的其他人。该网站免费向公众开放，并由志愿者团队维护。
ngs.io 简介
ngs.io 是一个专注于 NGS 生物信息学 的网站，提供 免费的在线工具、学习教程 和 社区论坛。
主要功能:
优势:
使用人群:
ngs.io 适用于以下人群：
案例分享:
ngs.io 已被广泛应用于生物医学研究和教育中，一些成功案例包括：
未来发展:
ngs.io 将持续更新和完善，提供更多强大的工具、丰富的教程和活跃的社区，成为 NGS 生物信息学者不可或缺的平台。
FlyBase是一个综合性数据库，用于收集和传播果蝇（果蝇果蝇）的信息。它包含有关果蝇生物学各个方面的丰富信息，包括基因组序列、基因注释、基因表达模式、突变体表型、交互作用网络等。
FlyBase由加州大学伯克利分校和加州大学圣地亚哥分校共同创建，由国家卫生研究院（NIH）资助。它的目的是为果蝇研究界提供一个集中的、可访问的资源，以促进果蝇作为模式生物的研究。
FlyBase 数据库包含大量的数据，包括：
FlyBase数据库可以通过其网站（https://flybase.org）访问。该网站提供各种搜索和浏览工具，允许用户查找特定基因、蛋白质、突变体或其他信息。数据库中的数据也可以通过编程接口（API）下载。
FlyBase数据库是果蝇研究界的重要资源，为研究人员提供了全面了解果蝇生物学的宝贵信息。它促进了对果蝇基因组、基因表达、突变体表型和基因相互作用的深入理解，并为果蝇作为模式生物的研究提供了坚实的基础。
Ploscompbiol.org是公共科学图书馆计算生物学（PLOS Computational Biology）期刊的网站。PLOS Computational Biology是一份同行评审的开放获取期刊，发表计算生物学领域的基础研究。该期刊由公共科学图书馆（PLOS）出版，是一个非营利组织，致力于使科学和医学研究成果更广泛地传播。
Ploscompbiol.org网站提供了该期刊发表的所有文章的存档，可以免费获取。该网站还包括有关期刊的新闻和博客文章，以及有关计算生物学领域的教育资源。
Ploscompbiol.org是计算生物学研究人员和对该领域感兴趣的人士的重要资源。该网站提供了对最新研究的免费访问，并为该领域提供了宝贵的教育资源。
JCVI.org
简介
JCVI.org 是一个非营利性组织，致力于通过基因组学和生物信息学来改善人类健康。它的使命是推进个人化医疗，通过获取和分析基因组数据来预防和治疗疾病。
历史
JCVI 成立于 1999 年，由克雷格·文特领导。它最初是私人拥有的，但于 2007 年成为非营利性组织。
研究领域
JCVI 的研究涵盖广泛的领域，包括：
主要成就
JCVI 的一些主要成就是：
影响
JCVI 的研究对医学和公共卫生产生了重大影响，包括：
资源
JCVI.org 网站包含大量资源，包括：
如需了解更多信息，请访问 JCVI.org 网站：https://www.jcvi.org/
您可以访问 BioPAX 组织的网站 biopax.org了解更多信息。 BioPAX 组织致力于开发和维护生物通路交换 (BioPAX) 标准。 BioPAX 是一种用于表示、存储和交换生物途径信息的开放标准。它旨在促进不同途径数据库和工具之间的互操作性。
MetaCyc 是一份有关生物化学途径和代谢的综合在线数据库。它提供了一系列广泛的新陈代谢途径图、酶信息、代谢物和反应信息。 MetaCyc 的目的是为生物化学途径的研究和分析提供一个集中式资源。它包含超过 2500 条在多个生物体中发现的途径，并不断更新以涵盖生物化学文献中的新信息。 MetaCyc 由 SRI 国际公司维护，并可通过其网站免费获得。该网站除了提供途径图外，还提供各种工具和资源，用于浏览和分析 MetaCyc 数据。这些工具包括用于搜索和浏览途径、酶和代谢物的工具，以及用于比较不同生物体中途径的工具。 MetaCyc 是生物化学研究人员的一项宝贵资源，因为它是关于生物化学途径和代谢的全面且不断更新的数据库。它为研究人员提供了一个集中式资源来查找有关特定途径或酶的信息，并比较不同生物体中途径。 MetaCyc 还可用于预测新途径或酶，并帮助生物工程师设计新的代谢途径。
RForge.net 是一个开源软件社区，为 R 编程语言提供包和协作工具。它的主要目标是为 R 用户提供一个共享和管理 R 包的平台，并促进 R 社区的发展和协作。
RForge.net 提供以下功能：
包存储库:用户可以上传、下载和管理 R 包。该存储库包含超过 17,000 个 R 包，涵盖各种主题，包括统计、机器学习、数据科学和生物信息学。
协作工具:RForge.net 提供一个 Git 服务器，允许用户托管和协作开发 R 包。用户可以创建和管理项目，跟踪版本更改，并与其他贡献者合作。
论坛和 wiki:R 社区可以通过论坛讨论技术问题、分享知识和协作项目。wiki 提供有关 R 编程语言和 RForge.net 使用的文档和教程。
其他功能:RForge.net 还提供其他功能，例如 RStudio 云计算环境、Crates.io 存储库（用于 R 软件包的二进制文件）和 R-Hub（用于 R 包的连续集成和部署）。
总的来说，RForge.net 是 R 用户不可或缺的资源，因为它提供了共享、管理和协作开发 R 包所需的工具和社区支持。
bio-itworld.com 是一个综合性的生物信息学门户网站，为生物信息学家、生物学家和对该领域感兴趣的人员提供广泛的信息和资源。该网站涵盖了该领域的各个方面，包括：
bio-itworld.com 由一群生物信息学家和计算机科学家管理，他们致力于为生物信息学社区提供准确、及时和有用的信息。该网站是生物信息学研究人员、从业人员和学生获取该领域最新动态和信息的宝贵资源。
Rosalind.Info是一个交互式的生物信息学平台，提供多种学习资源和挑战题。它旨在为生物信息学初学者和有经验的专业人士提供免费、开放获取的教育材料。
Rosalind.Info 的主要特点包括：
Rosalind.Info 的主要目标是：
Rosalind.Info 已被广泛用于教育和研究中。它已被大学和研究机构用作生物信息学课程的补充材料，并被专业人士用作自学和职业发展工具。
WormBase（https://www.wormbase.org/）是一个帮助研究人员发现新知识的网站。它提供了有关秀丽隐杆线虫的大量信息，秀丽隐杆线虫是一种小型的、生活在土壤中的蠕虫，是研究人类疾病和生物学中许多基本过程的模式生物。
WormBase包含有关秀丽隐杆线虫的各个方面的信息，包括其基因组、蛋白质组、生理学、行为和发育。该网站还提供各种工具，使研究人员能够分析数据并生成可视化结果。
WormBase由加州大学圣克鲁斯分校的一个研究小组维护。它由美国国立卫生研究院资助。
Landes Bioscience 是一家位于德克萨斯州奥斯汀的技术服务和出版公司，为生命科学行业提供各种服务。
其核心服务包括：
Landes Bioscience 还与学术机构和研究中心合作，提供定制的解决方案，满足其特定的研究和出版需求。
该公司成立于 1992 年，已成为生命科学行业的重要参与者，致力于通过其服务和资源推进科学研究和创新。
Encode Project是一个国际合作项目，旨在系统地绘制人基因组中所有功能元素的图谱。该项目于2003年启动，由国家人类基因组研究所（NHGRI）资助。 Encode Project的主要目标是确定人基因组中所有编码和非编码DNA序列的位置和功能。该项目已经取得了重大进展，并发表了许多重要发现，包括：
Fold.it是一款基于蛋白质折叠的研究游戏，由华盛顿大学开发。玩家通过操作蛋白质折叠，形成三维结构，从而帮助研究人员理解蛋白质是如何工作的。游戏提供了一个友好的界面，让玩家可以轻松地探索蛋白质折叠的复杂世界。玩家可以与其他玩家合作或竞争，争夺排行榜上的排名，还可以分享自己的解决方案和发现。
Fold.it通过结合游戏化的元素和真正的科学研究，使得蛋白质折叠的研究变得更有趣和容易。玩家可以探索不同的蛋白质折叠途径，测试假设，并获得关于蛋白质结构和功能的宝贵见解。游戏还包括一个社区论坛，玩家可以在其中分享技巧、讨论策略，并相互学习。
自2008年发布以来，Fold.it已吸引了来自世界各地的数十万玩家。玩家的贡献已帮助研究人员了解了多种疾病的蛋白质结构，包括阿尔茨海默病、帕金森病和癌症。Fold.it是一个令人着迷且有益的平台，它不仅提供了娱乐，还促进了对蛋白质折叠和蛋白质功能的科学理解。
Genecards.org 是一个大型的生物信息学数据库，它收集并综合了来自各种来源的基因组、转录组和蛋白质组数据。它由以色列魏茨曼科学研究学院（Weizmann Institute of Science）开发和维护。Genecards.org 提供各种工具和资源，包括：
Genecards.org 是生物医学研究人员、临床医生和学生的重要资源。它提供了一站式服务，可以访问有关人类基因组和蛋白质组的全面信息。
EMBL（欧洲分子生物学实验室）是一个世界上享有盛誉的生物学研究机构，总部设在德国海德堡。EMBL 的使命是通过促进基础研究，开发新技术和培训新一代科学家，促进整个欧洲的分子生物学研究。
EMBL 的研究活动涵盖分子生物学的各个方面，包括基因组学、蛋白质组学、生物信息学、结构生物学和发育生物学。EMBL 拥有世界一流的研究设施，包括一项尖端的DNA测序平台和一个蛋白质晶体学中心。
EMBL 也非常重视培训下一代科学家。该机构提供了一系列研究生课程、博士后职位和暑期实习机会。EMBL 的科学家还积极参与欧洲各地的外展活动，以激发公众对科学的兴趣。
EMBL 由27个欧洲成员国资助，是欧洲分子生物学组织（EMBO）的一部分。EMBL 是欧洲分子生物学领域领先的研究中心之一，并在理解生命的基本过程方面做出了重大贡献。
加州大学欧文分校的计算机科学系在计算机科学领域处于全球领先地位，其研究和教学在人工智能、计算机系统、网络安全和理论计算机科学等领域取得了广泛的认可。 UCI计算机科学系拥有国际知名的教员队伍，他们积极从事前沿研究并在顶级学术期刊和会议上发表论文。该系还与业界建立了密切的联系，为学生提供了宝贵的实习和职业机会。 UCI计算机科学系的学生不仅在技术方面受到良好的教育，而且还具备社会责任感，致力于利用他们的技能解决现实世界中的问题。该系为学生提供了各种机会，让他们参与社区外展活动，并与来自不同背景的人合作。
Molbiol.ru 是一个有关分子生物学的综合性网站。该网站由来自俄罗斯科学院和莫斯科国立大学的科学家们共同创建和维护。网站涵盖了分子生物学各个方面的最新研究成果，包括基因组学、蛋白质组学、生物信息学和系统生物学。
Molbiol.ru 提供了大量的信息资源，包括：
Molbiol.ru 是分子生物学研究人员、教师和学生的重要信息资源。该网站提供了全面且最新的分子生物学信息，并为分子生物学研究和教学提供了宝贵的工具。
国际计算生物学学会 (ISCB)
ISCB 是一家非营利组织，致力于促进计算生物学的研究、实践和教育。
使命
ISCB 的使命是：
活动
ISCB 通过以下活动实现其使命：
ISMB 会议
ISMB 会议是计算生物学领域最负盛名的国际会议之一。它每年举行一次，汇集来自世界各地的研究人员、从业者和学生。会议提供了一个平台，让他们分享最新的研究成果、讨论该领域的最新趋势并建立联系。
BMC Bioinformatics 杂志
BMC Bioinformatics 是一本同行评审的开放获取期刊，发表计算生物学各个方面的高质量研究论文。该期刊旨在促进该领域的最新发现和创新方法。
教育材料和课程
ISCB 提供各种教育材料和课程，以帮助计算生物学家提高他们的技能和知识。这些资源包括网络研讨会、教程、工作坊和在线课程。
职业发展机会
ISCB 为计算生物学家提供职业发展机会，包括奖学金、助学金和旅行补助金。该学会还提供指导计划，将资深研究人员与年轻的计算生物学家联系起来。
合作伙伴关系
ISCB 与研究机构和行业密切合作，促进计算生物学的应用。这些合作关系有助于将研究成果转化为现实世界解决方案。
会员
ISCB 的成员资格向来自世界各地的计算生物学家开放。会员资格的福利包括：
如果您对计算生物学感兴趣，我鼓励您加入 ISCB。该学会提供了一个宝贵的资源和支持网络，可以帮助您推进您的职业生涯和促进该领域。
基因组日本 (genome.jp) 是一個由日本国立遗传学研究所 (National Institute of Genetics, NIG) 和国立情報学研究所 (National Institute of Informatics, NII) 运营的生物信息学资源，为研究人员提供广泛的基因组学数据和工具。
数据资源
工具和服务
特点
genome.jp 是一个宝贵的资源，已广泛用于基因组学研究，包括疾病机制、药物发现和个性化医疗等领域。